Cuando la Liga de la Justicia desaparece y los villanos invaden Metrópolis, solo hay un equipo capaz de resolver el misterio: ¡Scooby-Doo y la pandilla! Pero, un momento, hay un nuevo perro: Krypto, el superperro de Superman con superpoderes. Misterios S. A. necesitará toda la ayuda posible cuando unos espectros amenazan el cuartel de la Liga de la Justicia. Además, ¿Lex Luthor finalmente se reformó? ¿O es cómplice del Guasón y Harley Quinn? Los supervillanos de DC ya se enfrentaron a Superman, pero ahora tienen nuevos oponentes: ¡una banda de chicos entrometidos!